Марина, судя по всему ваш сын таким образом выражает переполняющие его эмоции. Нужно несколько раз холодно и категорично сказать сыну, что так делать нельзя, что папе больно. Рассердиться на малыша, показать, как вам неприятно то, что он так делает. Если это происходит во время игры, то когда сын замахнется на папу, папе надо перехватить руку и холодно сказать, что ему не нравится, когда его бьют. Если же удар произошел, то остается только тоже самое сказать. Можно подсказать малышу, как лучше проявлять свои эмоции: "Лучше поцелуй папу" или "Если тебе нравится играть с папой - обними его".
 
Нельзя оставлять без внимания вот такие вот "перегибы", в то время как на незначительных проступках лучше промолчать или сказать о своих ожиданиях.