Екатерина, это, к сожалению, уже "углубившийся" страх. В своё время, лет в пять, а может и раньше, сын скорее всего начал бояться темноты и прочего. Потому что именно в этом возрасте развивается воображение. Но его страх не был проработан, так сказать... То есть скорее всего на это не обратили внимание, не поддержали ребенка, приняли за пустяк и т.д. Страх закрепился и поселился в душе сына.
Что делать сейчас - обязательно проработать страх с психологом!
А пока - понять, что сын действительно этого боится и не может сам с собой ничего поделать. Это его очень гложет изнутри, добавляет тревожности и нервозности. Когда вам страшно или плохо - что вам хочется от других, например, от мужа? Наверно понимания, поддержки, защиты, чтобы кто-то обнял... Вот и сыну нужны ваши объятия, ваше понимание (я тоже в детстве боялась того-то и того-то...), ваша поддержка (пойдем вместе зайдем в комнату), ваша защита (всё будет хорошо).
Можно попробовать попросить ребенка нарисовать свой страх, а потом придумать, как сделать это нечто пугающее - веселым, дружелюбным, смешным.  Нарисовать рядом фигурку вашего сына - как бы подружить их друг с другом.
Но реальную помощь смогут оказать только занятия с профессиональным психологом!

Я тоже за психолога, ребенку помощь специалиста нужна и чем раньше, тем лучше.

В любом случае я за то, чтобы попробовать разговорить ребенка, чтобы понять, что именно его так пугает. Далее попробовать придумать противовес страху, возможно с периодической коррекцией.
Простые разговоры маловероятно, что помогут, тут надо сделать так, чтобы ребенок поверил - Вы с ним заодно.
И потихоньку стараемся сначала заместить проблему.
Конечно это тоже не панацея, но это возможно сделать самому, не всегда же есть возможность работать с психологом.
Я кажется уже описывал тут опыт с маленьким Альбертом(суть метода легко найти в интернете по названию, это уже так сказать классика. Нас в описании этого опыта интересует как раз путь замещения страха). Это вполне достижимый даже не специалисту способ(только надо набраться терпения).
Но если есть возможность обратиться к проф. психологу - это гораздо лучше.
пы.сы. - будете читать описание самого опыта с маленьким Альбертом - будьте готовы к тому,  что сам по себе опыт достаточно неприятный, осужденный мировой общественностью в свое время как бесчеловечный(но это сама моральная сторона и первая часть опыта, она нас не особо интересует).
Как-то так...