екатерина, как правило дети - невольные отражатели своей семьи. насторожила ваша фраза про другими словами, самый близкий ребенку человек - родной отец (!) сознательно причиняет своему сыну боль!!!  кто же тогда защитит? кто поможет? на кого надеяться в этой жизни, если родной отец... что ж тут тогда удивляться???!!!! вполне естественно, что  сын в детском саду компенсирует свой страх перед отцом. нужно же ему где-то изливать свою отрицательную энергию и чувствовать свою значимость.  
критика ранит нас тогда, когда мы не уверены в себе, когда мы и от родителей слышим посыл "ты плохой", а когда мы узнаем, что и другие дети тоже, оказывается, так считают...  тут действительно мир рушится    

то, что воспитателей сын не слушается - тоже понятно. они "слабее" отца, с ними можно вести себя более свободно.
---
ребенку нужны адекватные, более - менее предсказуемые родители. а ещё нужна любовь, забота и внимание в сочетании с защитой и руководством. получает ли всё это ваш сын?  скорее всего нет. вот он и ведет себя так вызывающе - внимание любой ценой пусть и негативное.
---

постарайтесь пересмотреть свои взгляды на воспитание. хочу посоветовать вам книги людмилы петрановской "тайная опора: привязанность в жизни ребенка" . там всё прописано как всё должно быть в идеале, как строить взаимоотношения, что от нас ждёт ребенок и какими должны быть мы, родителями для своего ребенка от самого рождения вплоть до подросткового возраста и почему так должно быть. читая эту книгу, вы многое поймете и постараетесь изменить в отношениях с сыном. а так же рекомендую вторую книгу людмилы петрановской "если с ребенком трудно"  https://shkola7gnomov.ru/catalog/esli-s-rebenkom-trudno/   ну и конечно книги известного психолога юлии гиппенрейтер https://shkola7gnomov.ru/catalog/obshchatsya-s-rebenkom-kak-gippenreyter-yu-b/

анна, скорее всего тут совокупность причин.   то есть не только воспитание и образ жизни в семье, но и индивидуальность ребенка. один ребенок при таком отце станет робким и безынициативным, погрузится в свой мир. другой ребенок сделает вид, что слушается, а сам будет "отрываться" в другом месте...
а что касается наказаний. наказания бывают разными. если сын боится отца - это значит, что с наказаниями "перегнули". и потом, ребенку нужны не только наказания (хотя я бы заменила это слово "руководство"    ) , а внимание, любовь, забота!!! если перегиб в сторону руководства, то есть ребенком только руководят, но не проявляют свою любовь - что чувствует такой ребенок? просто поставьте себя на его место и вы всё поймете...
интересно, а что вы будете делать с подростком, который вас не будет слушаться? тоже бить по попе? или искать пути взаимодействия?
статьи по теме
воспитание без наказания
основные принципы воспитания детей

Дарья спасибо за ответ. С подростком уже поздно по моему договариваться и бить по попе)) он тебя либо уважает либо нет. Все уже заложено. Сын нас не боится, мы постоянно с ним целуемся и обнимаемся. я сама против битья, но когда сто раз повторишь а он не понимает, тогда я не выдерживаю((

Дарья, когда я говорила, что сын боится отца, я не имела ввиду, что наш папа тиран, он очень много занимается с сыном, гораздо больше,чем я . Они часто вдвоем, вместе играют в физические игры, муж его и обнимает и целует, и его наказания действуют по правилам 3х : сначала говорит, потом предупреждает, а потом действует - исполняет наказание. Просто до 2х лет я мужу не позволяла никак его ругать и уж тем более применять физическое насилие (читала много литературы на это счет), ребенок был просто не выносим в итоге : мы шли на улицу с криком, возвращались с криком, в магазине мог притворится мертвым!!! либо биться головой в витрину, если что- то не купят или откажут. Никакие уговоры на него не действовали! Чтобы уложить его спать - это была просто война. Я жила в кашмаре! в садике говорили в открытую : сегодня комиссия  - не приходите пожалуйста. Пока муж не занялся его воспитанием. Теперь дома это  чудесный ребенок, как я и писала раньше.
Семья у нас нормальная: мы с мужем не ругаемся, много времени проводим с детьми, муж может даже не есть после работы, чтобы пойти погулять с нами. Весь вечер всегда посвящен детям.
Про критику я имела в виду , когда он что-то ломает или ведет себя так, что мешает окружаюшим - ему делают замечание, что так и так себя вести нельзя - ты мешаешь, или посмотри что ты натворил, нужно сейчас же все починить - после чего у него случается валяние по полу, отрицание, слезы.
А то, что сын боится отца, я думаю дело не в "перегнули с наказанием", а в том что он понимает что он не прав, но все равно делает.
Сецчас нам почти 4 и в садике новая проблема: он не ходит в туалет! может даже обкакаться! Обследование проходили - все хорошо/

*спасибо за литературу

Жесть! Так жалко мамочку. Представляю сколько нужно терпения на все капризы ребёнка. Моё лучшее лекарство на все случаи жизни - смена обстановки. Возможно какая-то поездка. У меня есть мой папа, с которым ни один ребёнок не имеет права вести себя "плохо". Он строго объявляет об этом в начале общения, заинтересовывает интересными мужицкими делами и ни один ребёнок ещё ни разу не капризничал и не захотел к маме с этим нашим дедом.
Из рассказов я поняла, что ваш мальчик не боится папу. Он любит с ним быть и поэтому ведёт себя с ним лучше, чем с вами. Наверное ему с папой интереснее.
Восможно нужно корректировать такое поведение с психологом. Я постоянно бегала к садовскому психологу по всем вопросам. Тем более это бесплатно